Стартирайки дейност, МБАЛ - Самоков се утвърди като диагностично-консултативен и лечебен център за населението от близо 50 хиляди жители на град Самоков и другите 28 населени места в общината, от община Долна баня, 2 курортни комплекса и 16 вилни зони.
Структурата на болницата включва:
СТАЦИОНАРЕН БЛОК
Вътрешно отделение разположено на 6-ти етаж в два корпуса - блок А и блок Б с разкрити общо 45 легла и включва: Ендоскопски кабинет, Кабинет за функционално изследване на дишането и спирометрия, Център за обучение на диабетно болни.
Кардиологично отделение разположено на 7-ми етаж в два корпуса - блок А и блок Б с 32 болнични легла. Разполага със сектор за неинвазивна функционална диагностика на сърдечно-съдовата система и следните кабинети: Холтер ЕКГ и Холтер кръвно налягане; Велоергометрия и Ехокардиография на вътрешни органи; ЕКГ и кабинет за функционално изследване на дишането и спирометрия.
Хирургично отделение разположено на осмия етаж в двата корпуса - блок А и блок Б на основната болнична сграда с 30 болнични легла. Всички лекари, работещи в отделението са с придобита специалност Хирургия и дългогодишен стаж.
ОАИЛ се намира на 9-тия етаж на основната сграда на болницата, източен блок, в непосредствена близост до Операционния блок. Разполага с 8 легла, в т.ч 2 легла - Клинична токсикология. Всички лекари, работещи в отделението са с придобита специалност Анестезиология и интензивно лечение, дългогодишен стаж по специалността и необходимите сертификати за работа.
Детско отделение се намира на на 2-рия етаж в блок А и блок Б и разполага с 33 легла. Всички лекари на отделението са с призната специалност по Детски болести.
Отделение по нервни болести се намира на 5-тия етаж в блок А и е с 22 легла, разположени по две в стая със санитарен възел/баня и тоалетна/.
Отделение по ортопедия и травматология се намира на 3-тия етаж в блок Б и разполага с 9 легла. В отделението се извършват спешни и планови операции.
Акушеро-гинекологично отделение се намира на 3-тия етаж в блок Б и разполага с 22 легла. Гинекологичен и Патологичен сектор, интерупционна зала и ПКК се намират на 4-тия етаж на основната болнична сграда - блок А. В блок Б са разположени Неонатологичен сектор и стаи за родилките.
Операционен блок с началник - д-р Драгомир Дряновски и разполага с 5 операционни зали.
ОТДЕЛЕНИЯ БЕЗ ЛЕГЛА
Отделение по образна диагностика извършва качествена диагностика. В него работят висококвалифицирани специалисти, които извършват голям обем рентгено-диагностична дейност -графични, скопични и контрастни изследвания на всички органи и системи на човешкото тяло и мамографии.
Отделение по хемодиализа се намира на първия етаж на болницата и разполага с 10 хемодиализни поста.
Разполага с хемодиализна зала, оборудвана с 10 апарата за хемодиализа „Фрезениус”, като един от тях е предназначен за спешни диализи и един за инфекциозно болни.
Отделението е специализирано звено към болницата за лечение на болни с хронична бъбречна недостатъчност и болни с остра бъбречна недостатъчност.
Отделение по физикална терапия и рехабилитация разполага с 5 рехабилитационни легла разкрити в Неврологично и Травматологично отделение. Отделението е специализирано в следните сектори: Електролечение; Светлолечение; Кинезитерапевтичен и Термотерапевтичен сектор.
ДИАГНОСТИЧНИ ЛАБОРАТОРИИ
Клинична лаборатория - разположена на 3-тия етаж, работи с висококачествени реактиви и извършва изследвания на следните показатели: кръвна картина; коагулационен статус; кръвно-газов анализ; клинична химия –субстрати, ензими, микроелементи, електролити; хормони и тумурни маркери; анализ на урина и пунктати.
Микробиология - извършва качествена диагностика. Удовлетворява потребностите както на болницата, така и на пациентите от извънболнична помощ.
Отделение по клинична патология - разположено в подземния етаж на болницата. Извършва изработване на хистологични, цитологични препарати, включително хистохимични специални оцветявания, морфологична диагностика на тъканни и клетъчни материали.
ТЕЛК
Намира се на 2-рия етаж на болницата в блок Б. Има два приемни кабинета за преглед на болни и зала за техническа ябработка на ЕР. Разполага със специалисти по вътрешни болести, неврология, хирургия, очни и детски болести.
Работното време на ТЕЛК е от 8.00 до 16.00 ч.
БОЛНИЧНА АПТЕКА
Осъществява дейности по снабдяване на лечебното заведение с лекарствени продукти, медицински изделия и дезинфектанти. Там работят един магистър-фармацевт и един помощник-фармацевт.
КОНСУЛТАТИВНИ КАБИНЕТИ
Началник ДКБ е д-р Николинка Баранска и биват: Вътрешни болести, Кардиологични болести, Хирургични болести, Ортопедия и травматология, Детски болести, Неврологични болести, Инфекциозни болести, Гинекологични болести, Предродилен кабинет, Аудиологичен кабинет, Очни болести, Преданестезиологичен кабинет, Кабинет за определяне на кръвна група и съхранение на кръвни продукти до осъществяване на хемотрансфузията, Кабинет за профилактика и лечение на болни с напреднала хронична бъбречна недостатъчност и подготовка на пациентите със заместващите бъбреците методи.