КОЦ Бургас ЕООД приема пациенти, които боледуват от злокачествени новообразувания, преканцерози и доброкачествени тумори или съмнителни за такива заболявания.
Центърът разполага със специализирани отделения – Отделение по медицинска онкология, Отделение по онкологична хирургия/урология, функционират Отделение по анестезия и активно лечение, Отделение по онкогинекология и Отделение по лъчелечение – лъчелечение с линеен ускорител.
Стаите за настаняване на пациенти в Комплексен онкологичен център - Бургас ЕООД са с по две или три легла. Болничните стаи разполагат със собствен санитарен възел и телевизор, с изключение на стаите за интензивно лечение на пациенти.